Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TIMMDC1Q9NPL8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMMDC1Q9NPL8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms