Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCDH12Q9NPG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms