Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms