Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF2Q9HAU5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms