Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms