Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD3Q9H7B4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms