Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms