Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SENP3Q9H4L4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms