Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00597Q9H2U6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms