Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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