Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTMR12Q9C0I1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms