Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms