Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms