Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3Q9BY71 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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