Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC46A2Q9BY10 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms