Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms