Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL6Q9BWW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms