Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms