Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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