Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM43Q9BTV4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM43Q9BTV4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms