Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POP1Q99575 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POP1Q99575 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POP1Q99575 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP1Q99575 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP1Q99575 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP1Q99575 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP1Q99575 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP1Q99575 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms