Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT12Q99456 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms