Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACCSQ96QU6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACCSQ96QU6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms