Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms