Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms