Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF396Q96N95 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF396Q96N95 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF396Q96N95 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF396Q96N95 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF396Q96N95 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF396Q96N95 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms