Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms