Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP53Q96M91 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP53Q96M91 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms