Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms