Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms