Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCHS1Q96JQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms