Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms