Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS6Q96GS4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms