Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms