Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms