Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms