Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms