Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPSB1Q96BD6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPSB1Q96BD6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms