Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC7Q8WUI4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms