Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC4Q8TBB5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms