Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX2

SLC17A8, Vesicular glutamate transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A8Q8NDX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC17A8Q8NDX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A8Q8NDX2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms