Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC191Q8NCU4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms