Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms