Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms