Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms