Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8N9G6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8N9G6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8N9G6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8N9G6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8N9G6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8N9G6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms