Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms