Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms