Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms