Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPUSD2Q8IZ73 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms